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WB 标准protocol

成功完成Western Blot检测,必须满足4个条件:
1. 凝胶洗脱 :转移期间蛋白质必须从凝胶中洗脱出来,如果蛋白质还截留在凝胶中,将无法在膜上进行分析
2. 吸附到膜上 :在转移过程中蛋白质必须吸附到膜上,如果蛋白不吸附,将无法在膜上进行分析
3. 处理期间仍截留在膜上 :在转移后的处理过程中蛋白质必须保持吸附在印迹膜上
4. 处理过程中可接近 :被吸附的蛋白质必须能够与检测试剂接触,如果蛋白质被掩盖则无法检测
成功进行WB检测,则设置合适正确的对照是必不可少的,只要正确设置了这些对照,即可快速和准确的找到WB的问题所在,并保证实验结果的准确性和特异性!一般需要设置的对照如下:
• 阳性对照 :明确表达检测蛋白的组织或细胞,用于检测抗体的工作效率
• 阴性对照 :明确不表达检测蛋白组织或细胞,用于检测抗体的特异性
• 二抗对照 :不加一抗,用于检测二抗的特异性
• 内参对照 :检测标本的质量和二抗系统
• 空白对照 :不加一抗和二抗;用于检测膜的性质和封闭的效果
 
WB 检测基本过程
1 、获取细胞或组织裂解物
1) 根据检测蛋白的位置选择合适的裂解buffer:
 

蛋白位置 
推荐buffer
全细胞
NP-40 or RIPA
胞浆(可溶性蛋白)
Tris-HCl
胞浆(骨架结合蛋白)
Tris-Triton
膜蛋白
NP-40 or RIPA
核蛋白
RIPA or 核蛋白提取试剂盒
线粒体蛋白
RIPA or 线粒体分离试剂盒

亦可购买商业化的蛋白提取试剂盒来保证标本制备的质量
2) 选择合适的蛋白酶抑制剂,避免蛋白降解,从而保证检测的准确性!
2 、蛋白定量
常用的蛋白定量方法:Bradford assay, Lowry assay 或BCA assay。定量后,可根据情况将标本保存在-20°C /-80°C备用,进行免疫沉淀(IP)或者直接进行电泳分离蛋白
3 、电泳分离蛋白质
根据待测蛋白状态确定电泳条件:

待测蛋白状态
凝胶条件
上样buffer
电泳buffer
Reduced - Denatured
还原,变性
含β-巯基乙醇或DTT,含SDS
含SDS
Reduced - Native
还原,不变性
含β-巯基乙醇或DTT,不含SDS
不含SDS
Oxidized - Denatured
不还原,变性
不含β-巯基乙醇或DTT,含SDS
含SDS
Oxidized - Native
不还原,不变性
不含β-巯基乙醇或DTT,不含SDS
不含SDS

根据待测蛋白分子量大小确定凝胶浓度

蛋白分子量(kDa)
凝胶浓度(%)
4-40
20
12-45
15
10-70
12.5
15-100
10
25-200
8

4 、转膜
根据不同的检测目的和待测蛋白的特性,选择合适的膜类型。常用的转移膜类型有:PVDF膜、硝酸纤维素膜(NC膜)和尼龙膜,其中PVDF和NC膜的使用频率最高。各种膜的技术参数及比较如下:
 

 

PVDF

NC

尼龙膜

灵敏度和分辨率

背景

较高

蛋白结合能力

100-200ug/cm2 (适用于SDS存在时与蛋白结合)

80-100ug/cm2

>400ug/cm2

机械强度

干的膜易脆

软而结实

溶剂抗性

使用前是否需要浸润

100% 甲醛润湿

缓冲液润湿

缓冲液润湿

适用染色方法

胶体金、丽春红、酰胺黑、印度墨汁、考马斯亮兰

胶体金、丽春红、酰胺黑、印度墨汁

不能用阴离子染料

适用检测方法

显色法、化学发光、荧光、放射性、化学荧光、快速免疫检测

显色法、化学发光、荧光、放射性

显色、化学发光、放射性

适用范围

普通蛋白WB、糖蛋白检测、蛋白质测序、氨基酸分析、重复检测

普通蛋白WB、氨基酸分析、重复检测。0.1um膜适用于7kDa以下蛋白

低浓度小分子蛋白、酸性蛋白、糖蛋白、蛋白多糖、核酸检测常用

价格

较低

5 、封闭
去掉膜上多余的非特异性结合位点,降低背景。常用的封闭溶液有:含BSA或者脱脂奶粉的TBST或TBS
6 、一抗孵育
一抗的选择成功与否,是整个WB实验成功的关键:选择一抗有以下几个注意点:
• 选择适合检测标本种属的一抗(说明书有验证)
• 选择适用于WB实验方法的一抗(说明书有验证)
• 选择单克隆抗体或者经过亲和纯化的多克隆抗体
一抗的保存和使用:
• 根据说明书的要求条件进行抗体的保存;一般需要将抗体分装后放入-20度保存,绝对避免反复冻融。
• 抗体的工作液最好现配现用,在4度保存最好不要超过2周
• 根据说明书推荐浓度使用TBST稀释一抗。由于实验室条件和检测方法等的差异,说明书推荐的稀释比例只作参考,需要在说明书推荐的浓度周边进行多个浓度梯度的实验检测,然后选择信噪比最好的抗体浓度进行实验。如果说明书没有推荐浓度,可进行多个稀释比例进行摸索最佳稀释度(1:100-1:3000)。
• 孵育条件:推荐4°C孵育过夜(一般大于18个小时),根据抗体亲和力不同孵育时间有所区别
内参的选择和使用:WB过程监测以及目的蛋白定量的标准!
WB 常用内参及其技术参数:

内参名称

分子量大小

适用范围

beta-actin

43kDa

胞浆和全细胞

GAPDH

30-40kDa

胞浆和全细胞

Tubulin

55kDa

胞浆和全细胞

VCDA1/Porin

31kDa

线粒体

COXIV

16kDa

线粒体

TBP

38kDa

细胞核

详情请参考 “Loading Control–WB 不可或缺的武器”
7 、二抗孵育
根据说明书推荐浓度使用TBST稀释一抗。如果说明书没有推荐浓度,可进行多个稀释比例进行摸索最佳稀释度(1:1000-1:20000)。孵育条件一般为室温1-2小时
8 、底物孵育
选择显色或者化学发光底物。一般倾向于化学发光,灵敏度高且背景低,节省抗体用量
9 、结果分析和检测
凝胶成像系统检测或者暗室曝光到胶片
 
Note :从封闭开始,每步之间都需要用TBST进行洗涤,3次,每次5min
 

 

 

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