TUNEL检测细胞凋亡原理
细胞在发生凋亡时,会激活一些DNA内切酶,这些内切酶会切断核小体间的基因组DNA。细胞凋亡时抽提DNA进行电泳检测,可以发现180-200bp的DNA ladder。基因组DNA断裂时,暴露的3’-OH可以在末端脱氧核苷酸转移酶(Terminal Deoxynucleotidyl Transferase, TdT) 的催化下加上荧光素 (FITC) 标记的dUTP (fluorescein-dUTP) ,从而可以通过荧光显微镜或流式细胞仪进行检测,这就是TUNEL (TdT-mediated dUTP Nick-End Labeling) 检测细胞凋亡的原理。
Degradation of nuclear DNA can be examined by the TUNEL assay. This method is based on the enzymatic labeling within the cell of free 3'-OH groups at the ends of nicked DNA and the blunt ends of broken double-stranded DNA with fluorescein-labeled deoxyuridine.
Protocol for FACS
试剂配置:
1. PBS
2. 甲醛, 0.1% in PBS (6.25 ml 16%甲醛+90 ml水) prepare just before use.
3. EDTA, 20 mM, pH 8.0
4. 0.1% Triton X-100/BSA/PBS
PBS 5 ml
Triton X-100 5 ml 0.2%
BSA 50 mg
5. PI 500 μg/μL
PI/RNase A/PBS
TUNEL检测细胞凋亡实验流程
1. 3×106 cells, 离心,10 min, 4 ℃, 300 g
2. 0.5 ml PBS重悬
3. 5 ml 1%甲醛固定,4℃, 20 min,将细胞逐滴加入乙醇
4. 离心,小心用5 ml PBS重悬
5. PBS wash once
6. 0.5 ml PBS重悬
7. Fixed in 5 ml 75%冷乙醇over night,-20℃预冷,将细胞逐滴加入乙醇,-20℃可保存一周。
8. 离心,10 min, 4 ℃, 300 g,5 ml PBS wash very gentle twice
9. 1 ml PBS重悬,移入1.5 ml褐色离心管,从此避光操作。
10. 离心,10 min, 4 ℃, 300 g,收集细胞,用80 μl Equilibration Buffer重悬,5 min,室温。
11. Make reaction system: Equilibration Buffer 45 μl、d-UTP-FITC 5 μl、TdT Enzyme 1 μl。(For one test).
12. 离心,10 min, 4 ℃, 300 g,用50 μl Reaction system重悬,incubate at 37 ℃,水浴60 min。Shake tubes every 15 min.
13. 1 ml:20 mM EDTA终止反应,Vortex混匀,离心收集细胞。
14. 1 ml 0.1% Triton X-100+BSA+PBS, wash twice. 离心收集细胞.
15. 0.5 ml PI+RNase A+PBS重悬,室温放置15-30 min,in dark.
16. FACS。FL1+FL2。Setup negative and positive control sample.
Protocol for 组织切片 (In Situ Cell Death Detection)
1. 石蜡切片脱蜡(Dewax),复水(Rehydrate):
Incubate slides, 55°C, 30 min.
Xylenes (二甲苯), 2 times, 2 min. each
100% EtOH, 2 times, 2 min. each
95% EtOH, 2 times, 2 min. each
80% EtOH, 2 min.
75% EtOH, 2 min.
50% EtOH, 2 min.
2. dH2O rinse.
3. Permeabilise tissue: 21-37℃,蛋白酶K工作液中孵育15-30 min(视组织类型不同而选择),Solution must be pre-incubated for 30 mins at 37 degrees before use.
(替代方法:可以在渗透液中孵育8min)
(PK工作液:10-20ug/ml溶于10mM Tris-Cl,pH7.4-8,不含核酸酶;渗透液:0.1%TritonX-100+0.1%柠檬酸钠,现用现配)
4. PBS洗2次
5. 准备末端转移酶工作液(现用现配, ON ICE)。
6. 滴加末端转移酶工作液,覆盖parafilm,37℃于湿盒中孵育60 min(暗处放置)(阴性对照只加酶缓冲液)
7. PBS洗3次
8. 加AP标记的抗的高辛抗体37℃湿盒中孵育30min
9. PBS清洗3次
10. 加入底物NBT/BCIP
11. 15-25℃孵育10min显色
12. PBS清洗3次
13. 复染之后,封片,(封片使用PBS/甘油)
贴壁细胞MTT实验操作:
1. 接种细胞:收集对数期实验细胞,调整细胞悬液浓度(1×104~11×105个/ml),每孔接种100ul细胞悬液(每孔细胞数量103~104个/孔)。通常只选择中间60孔用作实验,边缘孔用无菌PBS填充(当然也可以用细胞培养基,只是有点浪费)。
2. 加药处理:5%CO2,37℃孵育至细胞贴壁后即可加药,通常我们选择在前一天下午种96孔板,次日上午加药处理细胞。一般设5-7个药物梯度(用完全培养基配置2×稀释液),每孔100ul药物稀释液;每个梯度(组)设3-5个复孔,建议设5个。
3. 5%CO2,37℃细胞培养箱孵育16-48小时(按实验需要选择)。
4. 每孔加入20ulMTT溶液(5mg/ml,即0.5%MTT),继续37℃细胞培养箱孵育4h(若药物与MTT能够反应,可先弃去孔内培养液,小心用PBS冲2-3遍后,再加入含MTT的培养液)。
5. 终止培养,小心吸去孔内培养液(通常我们选择一次性甩去孔内培养液)。
6. 每孔加入150ul二甲基亚砜,振荡2min,使结晶物充分溶解。在酶联免疫检测仪检测OD492nm/570nm各孔的吸光度值。
7. 特别说明:实验应同时设置调零孔(培养基、MTT、二甲基亚砜),对照孔(细胞、相同浓度的药物溶解介质、培养液、MTT、二甲基亚砜)
悬浮细胞MTT实验操作与贴壁细胞基本相同,只是第5步终止培养,去孔内培养液是应先用酶标板离心机4000rpm离心5~10min(如果没有也可以想其他替代办法)。
注意事项
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