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实验步骤

分子克隆效果图_画板 2.jpg

零背景Topo克隆与TA克隆的比较            
类型反应温度反应时间阳性率
零背景Topo(Y3033-25T室温(20-37℃)5-10 min☆☆☆☆☆
TA克隆16℃过夜☆☆☆

1 、YCR产物的准备

(1)引物不能磷酸化;

(2)YCR反应使用高保真及Taq DNA Polymerase均可(推荐Y3315-01Y3316-01);

(3)YCR产物推荐电泳后使用凝胶回收试剂盒进行纯化(推荐Y3642-100T)。

2、参考反应体系:

ComponentVolume
pSWE-Topo Zero Vector (50 ng/μL)1 μL
基因片段0.5-4 μL

插入片段推荐用量:载体与片段摩尔比=1:10-1:3。可以粗略地按照1 kb片段加入50 ng的量计算。如果构建基因文库可适当扩大反应体系。

3、按上述参考反应体系轻轻混合载体与基因片段,室温(20-37℃)反应5-10 min,将离心管置于冰上。

4、转化:a.在反应体系中加入50-100 μL克隆感受态(或将反应产物加入50-100 μL克隆感受态中),轻轻混匀,冰浴30 min;b.将转化体系立即于42℃热激45 s,立即置于冰上2-3 min;c.在转化体系中加入200 μL平衡至室温的SOC或LB培养基,200 rpm、37℃孵育1 h;d.取200 μL菌液涂布抗性平板,37℃倒置培养过夜(为得到较多克隆,可以离心后去掉部分上清,将菌液全部涂布抗性平板)。

5、阳性转化子检测:

a. 菌落YCR鉴定阳性克隆:挑取单克隆至10 μL无菌水中,涡旋混合,然后取1 μL混合液作为YCR模板,M13 Forward Primer和M13 Reverse Primer作为通用引物,进行菌落YCR鉴定阳性克隆。(推荐Y3315、Y3316;YCR反应体系及程序参考相应产品说明书,阳性克隆YCR扩增片段>100 bp)

b. 酶切鉴定阳性克隆:挑取单克隆接种于适量抗性液体培养基中,220rpm、37℃过夜培养。小量提取质粒,用适宜的限制性内切酶进行酶切,凝胶电泳鉴定阳性克隆。

c. 测序鉴定阳性克隆:使用M13 Forward Primer,M13 Reverse Primer引物测序并分析。


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